El dirigente peronista de Nogoyá fue denunciado por enriquecimiento ilícito por la revista "Análisis", en marzo de 2012. En mayo de este año, el exdiputado firmó un acuerdo de juicio abreviado en el que aceptó haberse enriquecido por más de 1 millón de dólares y se comprometió a devolver su mansión del Parque "Urquiza" de Paraná, valuada en más de 700 mil dólares; y una casa de calle Laprida tasada en 378 mil dólares. En el acuerdo alcanzado, Allende también reconoció el delito de negociaciones incompatibles con la función pública, por lo cual se le impuso una multa de 3 millones de pesos.
Y se lo condenó a una pena de prisión condicional de 2 años y 8 meses más la inhabilitación perpetua para ejercer cargos públicos. El acuerdo con la Justicia alcanzó también las amenazas a la ministra de Salud, Sonia Velázquez, y al periodista Martín Carboni.
