14 meses después de aquel nombramiento, el Ministro Rogelio Frigerio confió a Troncoso una nueva misión: reemplazar a la saliente Karina Palacios al frente de la Dirección Nacional de Asociaciones Sindicales.
El flamante puesto de Troncoso no sería de menor relevancia, en tanto y en cuanto le compete definir cuestiones sensibles para los gremios, sus internas, sus recambios y sus manejos de caja.
Manuel Troncoso llega a su nuevo rol con la venia del flamante secretario, Lucas Fernández Aparicio, pero fundamentalmente con el respaldo del ministro Rogelio Frigerio.
Troncoso será el encargado de cursar certificaciones de autoridades, validar elecciones, firmar personerías e inscripciones gremiales, convalidar memorias y balances, efectuar compulsas de afiliados y otras trámites de alto impacto en el mundo sindical.
Aún no trascendió quién reemplazará a Troncoso en la delegación del Ministerio de Desarrollo Social de la Nación en la provincia de Entre Ríos.